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近年來(lái),二代基因測(cè)序(next-generation sequencing,NGS)技術(shù)快速發(fā)展,其應(yīng)用已進(jìn)展至傳染病病原學(xué)的鑒定,臨床檢測(cè),如遺傳疾病、實(shí)體腫瘤、血液腫瘤、感染性疾病、人類白細(xì)胞抗原分析及非侵襲性產(chǎn)前篩查等。如2012的H7N9病毒疫情的快速確認(rèn),四川人感染H5N6禽流感病例及江西H10N8禽流感病例的發(fā)現(xiàn)等二代測(cè)序技術(shù)均發(fā)揮了重要作用。
2017年,甘肅省疾控中心國(guó)家移動(dòng)防疫中心建設(shè)配備美國(guó)(Life Technol Holdings Pte Ltd )的IonTorrent S5測(cè)序儀。2018年3月進(jìn)行安裝,調(diào)試,并開展第一次現(xiàn)場(chǎng)培訓(xùn)。 5月3日,負(fù)責(zé)熱電的工程師再次來(lái)實(shí)驗(yàn)室指導(dǎo)病原微生物實(shí)驗(yàn)室全體成員等進(jìn)行2017-2018年度流感病毒株的測(cè)序工作,經(jīng)過(guò)多次實(shí)驗(yàn)及反復(fù)摸索,加班加點(diǎn)的工作,經(jīng)過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn),少量標(biāo)本及多標(biāo)本的4輪檢測(cè),于5月15日完成了省流感監(jiān)測(cè)參比中心年度30株流感病毒毒株的全基因測(cè)序任務(wù)。
目前,甘肅省疾控中心病原生物實(shí)驗(yàn)室年輕的骨干已經(jīng)初步掌握了病毒測(cè)序的整個(gè)流程,制定了流感病毒測(cè)序的SOP,測(cè)序結(jié)果分析的分析等。二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)的建設(shè),為我省傳染病病原快速鑒定,基因序列分析,耐藥基因測(cè)序,變異變遷研究奠定了基礎(chǔ),標(biāo)志著省疾控中心傳染病病原學(xué)檢測(cè)能力進(jìn)一步提升。(病原生物實(shí)驗(yàn)室)



